とりあえず結論          


皮膚病(真菌病)の可能性があります。不衛生飼育により、水質の悪化により
最近が増殖し、病気を発症させたものかと思います。一部怪我をしていてそこから最近が増殖した可能性もあるかと思います。
いずれにせよ下記のヨードチンキの方法で改善することが多いです。一応、あくまで応急処置としてみてください。

                    ヨードチンキ

水質の維持に大事なことは?
水換えを頭数に合わせて1〜2日に一回は出来れば行う。
ろ過装置(大型や小型の投げ込み式)を用いる。
グリーンウォーターを作り使用する。
皮膚病予防には?
陸場を設置し、しっかり紫外線(日光)に当たり甲羅干しが出来る
状態にしてあげる(あるいはホットスポット)。
その他、水質の維持と同様。